Блог

Apr 22, 2024

Стартап по цифровой ПЦР Enumerix's Ultra

НЬЮ-ЙОРК – Enumerix, новая компания по цифровой ПЦР, созданная командой звезд индустрии геномики, вышла из скрытого режима с помощью недорогого метода цифровой ПЦР, который может генерировать 30 миллионов капель в год.

НЬЮ-ЙОРК – Enumerix, новая компания по цифровой ПЦР, созданная командой звезд геномной индустрии, вышла из скрытого режима с помощью недорогого метода цифровой ПЦР, который может генерировать 30 миллионов капель на реакцию, значительно расширяя динамический диапазон по сравнению с текущим. технологии.

Фирма под названием Ultra-dPCR планирует выпустить коммерческий продукт на основе этого метода к концу следующего года, первоначально ориентированный на рынки исследований и неинвазивного пренатального тестирования.

Фирма продвигает свою технологию как подобную секвенированию следующего поколения, и в качестве доказательства концепции широкого динамического диапазона она разработала анализ НИПТ, который обнаруживает в общей сложности 222 локуса в хромосомах 13, 18 и 21 в однотрубный рабочий процесс.

Enumerix была основана в 2019 году Стивеном Фодором, Кристиной Фан и Ари Чейни — трио, которое ранее работало вместе в фирме Cellular Research, занимающейся анализом одиночных клеток.

Команда имеет впечатляющие добросовестные достижения в области геномики. Ранее Фодор был соучредителем Affymetrix в 1992 году, а Фан известен как соавтор НИПТ вместе со Стивеном Квейком. Чейни, Фодор и Квейк основали Cellular Research в 2011 году. Эта фирма была приобретена в 2015 году компанией Becton Dickinson в рамках более широкой стратегии геномики для исследований отдельных клеток, а Affymetrix была приобретена в 2016 году за 1,3 миллиарда долларов компанией Thermo Fisher Scientific.

Аарон Соломон, генеральный менеджер Enumerix, сказал в интервью, что команда «добилась большого успеха в Cellular Research и решила, что это очень весело, и они хотят сделать это снова».

Метод цифровой ПЦР Enumerix не требует микрофлюидики, а использует недорогие расходные материалы в сочетании со стандартным лабораторным оборудованием.

По словам Соломона, генератор капель представляет собой пластиковое устройство с порами.

Этот кусок помещается в стандартный тюбик-стрип емкостью 200 микролитров. Образец загружается вместе с запатентованным эмульсионным веществом Enumerix, затем полоска пробирки загружается в адаптер, который позволяет поместить его в любую стандартную лабораторную центрифугу.

«Он вращается в течение 20 минут, и центробежная сила создает поток капель, которые попадают в пробирки для ПЦР», — сказал он.

Химический состав эмульсии компании был разработан для осаждения капель на дно трубки, что позволяет более эффективно нагревать и охлаждать в стандартном термоциклере. Это также ясно, поэтому можно легко выполнить 3D-изображение трубки с помощью фирменного сканера Light Sheet.

Увеличенное количество разделов может увеличить динамический диапазон обнаружения по сравнению с другими методами. Соломон сказал, что реакции имеют нулевой мертвый объем и могут быть загружены в четыре раза больше образца, чем другие технологии, что может повысить чувствительность. Это может быть особенно важно при обнаружении редких молекул, например, при жидкой биопсии.

Как описано в журнале Analytical Chemistry на этой неделе, прибор для визуализации отбирает 500 кадров капель эмульсии и компилирует их для создания трехмерной реконструкции пробирки для ПЦР. Затем специальное программное обеспечение определяет перегородки и подсчитывает флуоресцентные капли.

Light Sheet в настоящее время настроен на обнаружение четырех цветов, и Соломон сказал, что фирма может легко использовать комбинаторные методы для обнаружения 12 целей в одном анализе. «Мы можем сделать некоторые другие трюки, чтобы выйти за рамки этого», - сказал он.

Общее время обработки 48 образцов составляет два часа, а рабочий процесс также поддается автоматизации.

Соломон сообщил, что общая стоимость расходных материалов на один образец составляет менее 10 долларов. Enumerix планирует коммерциализировать расходные материалы, считывающий инструмент и фирменное программное обеспечение для визуализации пробирок, при этом стоимость сканера Light Sheet «сопоставима с другими сканерами, представленными на рынке в сфере цифровой ПЦР», — сказал Соломон.

В то время как другие инструменты работают с более чем четырьмя логами динамического диапазона, Соломон сказал, что Ultra-dPCR расширяет этот диапазон до двух журналов. «Это означает, что мы можем обеспечить дополнительную чувствительность, и нам не нужно титровать до правильной концентрации обнаружения», — сказал он.